Baptisterium Pisa atau Baptisterium Santo Yohanes (bahasa Italia: Battistero di San Giovanni) adalah bangunan agama Katolik yang terletak di kota Pisa, Italia. Pembangunan baptisterium ini dimulai pada tahun 1152 untuk menggantikan bangunan baptisterium yang lebih lama. Setelah pembangunannya diselesaikan pada tahun 1363, bangunan ini menjadi bangunan kedua di Piazza dei Miracoli. Baptisterium Pisa terletak di dekat Katedral Pisa dan Menara Miring Pisa.
Baptisterium ini dirancang oleh Diotisalvi dan merupakan baptisterium terbesar di Italia. Tingginya mencapai 54,86 m dengan diameter 34,13 m. Baptisterium Pisa dianggap sebagai contoh transisi dari gaya Romanesque ke Goth: bagian bawahnya bergaya Romanesque dengan lengkungan bundar, sementara bagian atasnya bergaya Goth dengan lengkungan lancip. Bahan baku utama baptisterium ini adalah marmer.
