Deggendorf (bahasa Bayern: Degndorf) adalah ibukota distrik Deggendorf di Bayern, Jerman. Kota Deggendorf memiliki luas sebesar 77.21 km². Deggendorf pada tahun 2006, memiliki penduduk sebanyak 34.154 jiwa.
Jejak permukiman terawal di daerah ini ditemukan dekat Donau, sekitar 8.000 tahun yang lalu. Penemuan arkeologis Abad Perunggu dan Keltik menandakan bahwa daerah ini terus-menerus dihuni selama bertahun-tahun. Heinrich II, Kaisar Romawi Suci menegakkan supremasi atas daerah ini pada tahun 1002. Setelah Perang Dunia II, terdapat Kamp Orang Pindahan di Deggendorf, yang berisikan pengungsi Yahudi.
